Андрей Моисеенко работает в Курганском филиале Альфа-Банка с 2000 года, сначала — в должности Начальника Отдела по работе с предприятиями промышленности Управления по работе с клиентами, затем, в 2001-2002 годах, являлся Директором филиала КБ «Драгоценности Урала», в 2002 году вернулся в Альфа-Банк и был назначен заместителем управляющего филиалом.